1.《环境保护税纳税申报表》分为A类申报表(以下简称A表）和B类申报表(以下简称B表)。
首次申报环境保护税的纳税人应同时填报《环境保护税基础信息采集表》(附件3)，包括1张主表和4张附表，用于采集纳税人与环境保护税相关的基础信息。纳税人与环境保护税相关的基础信息发生变化的，应及时向主管税务机关办理变更手续。
2.A表共有6张报表,由1张主表和5张附表组成,适用于按照《环境保护税法》第十条前三项规定的自动监测、监测机构监测、排污系数和物料衡算法计算应税污染物排放量的纳税人,即非抽样测算法计算污染物排放量且按期申报环保税纳税人的纳税申报。主表《环境保护税纳税申报表(A类)》适用于纳税人按月汇总所有污染物的明细申报数据,得出本期应缴纳税款。前4张附表是根据水声、渣四类污染物类型设计的报表模式,分别适用于纳税人分类按月计算应税大气污染物、水污染物、固体废物以及工业噪声的排放量。第5张附表适用于享受减免税优惠纳税人的减免税明细计算申报。
纳税人在填写A表附表1(大气污染物适用及附表2(水污染物适用)时需要注意,《环境保护税法》第九条规定,每一排放口或者没有排放口的应税大气污染物,按照污染当量数从大到小排序,对前三项污染物征收环境保护税;每一排放口的应税水污染物,对第一类水污染物按照前五项征收环境保护税,对其他类水污染物按照前三项征收环境保护税;同一排放口,应税污染物项目数可依各省、自治区、直辖市人民政府需要而增加。因此,在纳税申报前,纳税人需要自行计算每一排放口或者没有排放口的应税大气污染物从大到小前三项,以及每一排放口的应税一类水污染物前五项,其他类水污染物前三项的污染当量数,然后再填写。
主表是《环境保护税纳税申报表（A类）》，用于纳税人对按月计算的明细数据进行季度汇总申报。
附表用于纳税人分类按月计算应税污染物排放量。纳税人享受减免税优惠的需填报减免税明细计算报表。
附表1.1适用于对大气污染物按月明细计算排放量；
附表1.2适用于对水污染物按月明细计算排放量；
附表1.3适用于对固体废物按月明细计算排放量；
附表1.4适用于对工业噪声按月明细计算排放量；
附表1.5适用于享受减免税优惠纳税人的减免税明细计算申报。
3.根据《环境保护税法》及其实施条例规定,固体废物的排放量为当期应税固体废物的产生量减去当期应税固体废物的贮存量、处置量、综合利用量的余额。不过,在填写A表附表3(体废物适用)时,只涉及减除当期固体废物的贮存量及处置量,不涉及当期固体废物的综合利用当期固体废物的综合利用将在附表5《环境保护税减免税明细计算报表》中体现。还应注意的是,固体废物的贮存量、处置量,是指在符合囯家和地方环境保护标准的设施、场所贮存或者处置的固体废物数量,对于不符合规定的贮存量和处置仍需缴纳环保税,不得作为报表中的减除项目填报;固体废物的综合利用量,同样要符合国务院有关门关于资源综合利用要求以及囯家和地方环境保护标准。
4.B表共1张报表,适用于除A类申报之外的其他纳税人，包括按次申报纳税人、适用《环境保护税法》所附《禽畜养殖业、小型企业和第三产业水污染物当量值》表的纳税人和采用抽样测算方法计算污染物排放量的纳税人的纳税申报。值得一提的是,同时存在采用《环境保护税法》第十条前三项方法计算应税污染物排放量且按期申报,又存在釆用抽样测算方法计算应税污染物排放量的纳税人,需在同一所属期内分别填报环保税申报表A表和B表。另外,A表附表5《环境保护税减免税明细计算报表》中,先填写污染当量数或综合利用量,后填写本期减免税额;B表则直接填写本期减免税额,不再填写污染当呈数或综合利用量。
除按次申报外，纳税人应按月填写B类表，按季申报。
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